这是一个不幸的事实：最需要加强卫生人力资源建设的国家，其掌握的数据和信息却最琐碎、最缺乏可信度。大多数国家，也可能是所有国家，都缺乏协调联动的收集、处理、传播卫生人力全面及时信息（包括人力储备、分布、经费和变化决定因素）的专用系统。不同信息的来源包括卫生专业人员监督机构、各地区卫生信息记录中关于卫生机构工作人员安排的信息、人口或机构调查、工资单记录、工作许可证记录或其他来源。因此卫生部或其他利益相关方经常依靠根据不同来源整理的报告获取信息。这些不同来源获得的信息，其完整性、时效性、可比较性也因来源不同而彼此参差不齐。

另外一个挑战是大多数国家没有获取有关参与保持、促进和恢复卫生系统所需的大多数卫生人力的综合数据。例如，只有少数国家会对卫生系统管理和支持人员（包括管理人员、行政人员、专业人员、办事人员以及其他非接受卫生服务提供专业培训但在卫生部门工作的人员）的统计数据进行日常收集和传播。《世界卫生报告（2006）》中指出，仅有不到三分之一的国家报告了此类数据 ^［4］。但是这些工作人员，作为卫生人力的关键组成部分，据估计人数已经占到全世界卫生人力资源总数的三分之一；不包括这部分工作人员的官方统计将导致大幅度过低报告卫生人力储备，并忽略加强卫生系统绩效的一大部分潜能。许多国家在多个不同维度（如各部门人员分布、地理、性别、劳动力活动、工作地点、报酬等）缺乏及时、可靠的卫生人力资源不平衡有关信息。

即使在相对可获得数据的国家，把信息转化为可供规划者、政策制定者和利益相关方适用的证据也受到来自职业分类缺乏一致性的强大阻挠和将多源信息集合在一起的挑战。国家发展水平和文化上的差异也会造成卫生工作者的角色和任务上的差异，任何致力于提高跨国界和时间趋势可比较性的尝试都需要注重采用能使数据收集、处理和传播途径协调一致的方法。

在卫生人力资源信息系统的发展与巩固过程中还要进一步面对因标准指标未达成共识、测量策略投资不足等挑战，这些问题都是卫生人力资源干预监测与评估的核心问题。现在仍需为建立一致的最低指标体系做出努力，以便让这些最低指标能宽泛地反映出卫生人力资源动态的不同维度和复杂性，同时又要让该最低指标体系能够具有足够的全面性供公共卫生的卫生人力资源领域决策使用。目前除了最普遍的卫生专业人员分类密度（医生、护士、助产士）之外，国际上还没有普遍达成一致并报告出来的系统化指标。但这项普遍指标也在政策和规划中体现出严重的局限性，因为该指标在设定周期性目标时还会受到人口结构变化、疾病负担、卫生人力技能组合和其他因素的影响。