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一、原核生物表达系统
原核生物细胞结构的主要特征是不具核膜，核物质裸露，没有有丝分裂过程，如细菌、放线菌等原核生物。原核生物表达体系一般都采用大肠埃希菌，其表达系统是最早用于表达外源蛋白的系统。经过几十年的发展，此表达系统的相关技术逐渐成熟，在载体和菌株上也有很多选择，是目前基因工程中最常被人们使用的表达系统。作为目前应用最为广泛的蛋白质表达系统，大肠埃希菌表达系统已成功地表达了多种外源蛋白。
(一)优点
在已经建立的外源蛋白表达系统中，大肠埃希菌表达系统是技术最成熟的原核表达系统。其传代时间短，营养要求简单，遗传背景清晰，表达周期短，能够高效、迅速地表达外源蛋白，表达量大（可达宿主总可溶性蛋白的13%～30%，甚至高达80%以上），操作简单，容易培养，可进行基因组改造，大规模培养成本较低，在基础研究、工业用酶和医用蛋白生产中应用最为广泛，已经发展并建立了各类菌株和载体系列。
(二)不足
作为原核生物的大肠埃希菌表达系统，不具有真核生物基因表达的调控机制和蛋白质加工修饰的能力，因此，表达产物不具天然蛋白质构型，表达产物大都积聚在细菌的包含体内，以没有活性的包含体形式存在，严重制约了大肠埃希菌表达系统的应用。