在信息传递过程中，海马接受联合皮质、嗅皮质、屏状核、杏仁、伏隔核、丘脑和小丘脑的传入纤维，又通过传出纤维投射至联合皮质、乳头体、丘脑前核、外侧隔核和下丘脑等。这种广泛的纤维联系提示海马的功能是将各种传入的感觉整合成有条理的、连贯的信息返回皮质，形成情节记忆。大量动物研究显示，应激和应激激素可导致海马神经元树突形态学改变和抑制神经的发生，加速海马神经细胞的死亡，进而广泛地影响认知和学习过程，损害海马依赖性的记忆。PTSD与应激最为密切，应激激素水平显著升高，自然会对海马造成损害。功能影像研究还发现，在呈现了潜意识表征水平的恐惧和愤怒的脸谱时，杏仁核的活动更强烈；这说明杏仁核是针对性参与非陈述性、内隐记忆的加工。