混合模式的CTF赛制是结合了解题模式与攻防模式的赛制。参赛队伍通过线上答题获取一些初始分数，然后通过攻防对抗进行得分增减的零和游戏，最终以得分高低分出胜负。
大型的CTF竞赛多采用混合模式CTF赛制，如iCTF（The International Capture The Flag Competition）。
