1.简述系统发育树的作用及其构建方法。
2.系统发育树的文件格式一般有哪些？并详述最为广泛使用的格式。
3.简述哪些函数用于读取以下输出文件。
（1）Newick输出文件。
（2）RAxML输出文件。
（3）BEAST输出文件。
（4）MrBayes输出文件。
（5）HyPhy输出文件。
（6）CODEML输出文件。
（7）mega输出文件。
（8）r8s输出文件。
