水选是将药物通过水洗或漂除去杂质的常用方法。主要用于除泥沙、盐分以及表面附着物，以使药物洁净或使某些药物减毒。如海藻、昆布、牡蛎、乌梅、山茱萸、大枣、川贝母等经水选后除去泥沙和表面不洁物。一些有毒的药材，如半夏、天南星、川乌、草乌等，需浸漂较长的时间以降低毒性。洗漂应掌握好时间和水量，勿使药物在水中浸漂过久，以免损失药效，并及时注意干燥，防止霉变，降低疗效。常用水选设备有循环水洗药机、喷淋式滚筒洗药机、籽实类药材清洗机等。
