《夜航船》全书共分为二十卷，依照门类划分为二十部，以词条的方式进行撰写介绍，收录四千余条目。内容囊括天文地理、人伦考古、经史百家、礼乐典章，以及日用宝玩、植物四灵、三教九流、物理方术，广采博收，涉及全面，堪称“中国的小型百科全书”。
本书以中华书局2015年出版的《夜航船》为底本，参考了浙江古籍出版社、四川文艺出版社等出版的多部读本编辑而成，力图接近原貌。凡底本文字可通者均不再据原文回改，以存其旧。文中有些繁体字为古用，也不做修改。个别确实影响文意或显系钞误者径改，以方便读者的阅读。
