肾为先天之本，藏先天之精。肾精生血乃为月经的物质基础，且肾精能化肾气促使天癸充盈。《素问·上古天真论》亦有云：“女子七岁，肾气盛，齿更发长；二七而天癸至，任脉通，太冲脉盛，月事以时下……七七任脉虚，太冲脉衰少，天癸竭，地道不通，故形坏而无子也。”该经文充分证明了月经的初潮、绝经与肾有密切相关，决定于肾气的盛衰。所以卵巢早衰，月经早绝发生根源在肾。

卵巢早衰以肾虚肾精亏虚为本。肾为天癸之源，为冲任之本，为气血之根。肾气不足，不能温化肾精以生天癸，通达冲任，温养胞宫；肾-天癸冲任-胞宫轴的功能低下，月水难生；肾精不足，精亏血少，冲任血虚，冲脉经血亏虚，任脉之气衰竭。所以先天不足，或任何原因累及肾，肾精亏虚，肾水匮乏，则经水干涸；或气血不足，冲任功能早衰，经血的生成障碍致胞宫胞脉空虚，无血可下均可早发绝经。故本病其本在虚，主要是肾虚也。

虽然说该病发生是以肾虚为根源，但人体是一个有机的整体，在生理上互相协调，在病理上互相影响，而且肾与心肝脾关系非常密切，心为君火，肾主元阴，水火既济，心肾相交，彼此交通相互协调关系。肾虚累及心，会出现一系列心肾不交的症状。肾藏精，肝藏血，精血同源，互相滋生，肾虚精血不足，必定累及肝，引起肝血不足，或肝气失去条达，临床出现与肝肾有关的症状。脾为后天之本，气血生化之源，脾胃健旺则精血化生有源，气血充盈，可以后天养先天之虚，延缓肾气衰退的进程。肾虚也会影响脾胃，临床出现与脾肾有关的症状。综上所述，肾与心肝脾关系甚为密切，所以肾虚会累及心肝脾，促使卵巢早衰。