2 问题及原因分析
2.1 湖泊保护方面
2.1.1 湖面遭到蚕食
新中国成立初期湖北省面积6.67hm2以上的湖泊有1332个，水域总面积8528km2；可是到2012年，“一湖一勘”成果表明，面积6.67hm2以上的湖泊仅有728个，水域总面积只有2000km2。湖泊数量减少近50%，水域面积不及新中国成立初期的25%。短短60多年，人类活动对湖泊伤害之重令人触目惊心；若再不进行保护，可能要不了多少年，“千湖之省”就将成为历史的记忆。
2.1.2 渔业养殖过度
湖北省湖泊绝大多数具有养殖功能，是淡水鱼及其他水产品主要生产基地。基于此，各级政府和当地老百姓为提高经济效益采取各种办法开展渔业生产，大量采取围堤、围栏和围网方式，建精养鱼池，饲养滤食性鱼类如鲢、鳙，为提高渔业产量，投饵投肥难以避免，过度养殖造成湖泊富营养化现象越来越严重。
2.1.3 保护意识淡薄
湖北省湖泊数量多、湖岸线长、情况复杂，无论是城中湖还是乡村湖，各种有损湖泊健康的行为时有发生，如投饵投肥、暗管排污、非法填埋、倾倒垃圾等等；所有这些现象仅仅依靠有限的监管部门和更有限的监管人员是远远不够的，而是需要沿湖百姓都来保护和参与。但调研发现，大多数沿湖居民对上述损害湖泊健康的行为均视而不见、充耳不闻，只有此类行为损害到自己的生活和利益了，才会向当地政府和媒体反映问题，广大民众的湖泊保护意识极为淡薄和缺失；而这种迟到的反馈信息，无疑使得湖泊侵害和污染已经既成事实，填土难以挖除、污染难以治理、损害难以复原，很大程度上降低了湖泊管理的效率，增大了湖泊治理成本，错过了湖泊保护的最好时机。
2.2 水利设施方面
2.2.1 堤防建设标准低
湖北省湖泊湖围堤防大多形成于20世纪50—60年代，因陋就简，就地取材，就地建设。因此，大多堤防是在湖底淤泥基础上形成的，沉降严重，虽逐年加培，但达到设计标准的很少；加之湖堤上的涵闸、泵站等建筑物设计标准低、运行时间长、老化严重、长期带病运行，当汛期到来时，险象环生。
2.2.2 防洪排涝能力不足
湖北省湖泊设计防洪能力大多为10年一遇～20年一遇，少数为50年一遇标准；排涝能力大多为5年一遇～10年一遇，少数为20年一遇标准；无论是防洪或是排涝能力最好的也仅仅只达其下限，大多数湖泊防洪排涝能力远远达不到设计标准要求。
2.3 水生态环境方面
2.3.1 水污染日益突出
2013年，全省对列入《湖北省第一批湖泊保护名录》中的308个湖泊展开了水质监测工作，统计了98个城中湖泊及82个水域面积大于5km2重点湖泊的水质状况。结果表明：全省湖泊水质总体为中度污染，主要污染指标为总磷（TP）、化学需氧量（COD）、五日生化需氧量（BOD5）；面积大于5km2重点湖泊水质总体为轻度污染；城中湖泊水质总体为重度污染，富营养化现象较为严重。导致城中湖泊普遍呈现富营养化状态的主要污染源包括以下几个方面：
（1）点源污染。生活污水、工业废水、污水处理厂尾水等排放入湖。
（2）面源污染。老城区无法实现彻底截污及雨污分流，大量污染物随地表径流进入城中湖。
（3）内源污染。投肥投饵养殖和不科学清淤累积了大量污染物的沉淀物，在水流和波浪等水动力的作用下，不断重复着沉淀和再悬浮的过程，持续释放污染到水体。
2.3.2 水生态环境持续恶化
由于湖泊面积萎缩和容积减少，湿地植被与野生动物生存环境受到限制，水生态系统恶化加剧，导致生物数量下降、多样性减少、物种结构改变、部分水生植物濒临灭绝。通过对城中湖泊的水生动植物调查发现，湖泊中通常没有沉水植物生长；湖泊周边过度硬化，或成为社区，或建成驳岸，或铺成硬质路面，植被缓冲带缺失或宽度不足；鱼类群落结构不合理，多数以杂食性的鲤、鲫为优势种，缺乏在食物网中处于高营养级别的鳜、鲶、乌鳢等肉食性鱼类；底栖动物群落退化严重，未发现螺、蚬、蚌类等大型底栖动物，以富营养化指标种摇蚊幼虫和水丝蚓等小型底栖动物为优势种，在一些清淤过度的水域，甚至未发现任何种类的底栖动物；大型浮游动物密度低，浮游动物小型化，主要是轮虫、剑水蚤、变形虫、污钟虫等中污带和多污带的指示物种；营养盐循环速率高，沉积物-水耦合作用剧烈，底泥易再悬浮；食物链短，生态系统结构简单，多样性低，自净能力普遍较弱。
2.4 湖泊管理方面
2.4.1 管理体制不顺
目前涉湖管理的部门有水利、水产、环保、林业、农业、国土、建设、旅游、海事（公安）等部门，管堤防的不管水面，管水面的不管水质，管水质的不管功能，看似“九龙治水”，实际上是都管又都不管，缺乏联动机制。
2.4.2 综合管理执法难
虽然在《湖北省湖泊保护条例》的要求下，成立了一些湖泊专管机构[3]，但主要负责监督协调、宣传和服务，没有真正的执法权，对违规违建、违法圈地填湖、污水直排入湖等现象，执法主体缺失；再者，绝大多数湖泊没有设立水文和水质监测站，没有连续的水质与水生态监测数据。因此，制定不出科学高效的管理方案和措施，湖泊管理举步维艰。