有GDM病史的妇女不但将来发生2型DM的危险性增加，而且发生1型DM的危险性也增加。丹麦的一项研究发现以往患过GDM的妇女，部分产后用OGTT诊断为2型DM，但OGTT正常者及2型DM其HLA-DR ₂，DR ₃及DR ₄抗原与正常人群相似，而发展为1型DM者与其他非GDM者发生1型DM者的特点相似。通常认为2型DM患者并无特殊的HLA型别。但芬兰的一项研究表明，2型DM的男性老年患者有较高的HLA单倍型存在。有GDM病史者HLA-DR ₃及DR ₄增加，发展为2型DM和1型DM者其HLA-DR ₂下降，OGTT保持正常者则较少出现这种情况，表明GDM与1型DM类似，也可能是一种遗传性疾病。近年来有推测GDM的发生是因为胎儿抗原负荷过大所致，HLA-G的作用是通过下调细胞毒性T细胞对胎儿滋养层的反应而起到免疫逃避作用，同样机制对胰岛细胞也有类似作用。HLA-G和核因子-κB（NF-κB）之间的相互作用是导致GDM的重要机制，这与器官移植后易发生DM有类同之处。两种情况均是抗原负荷启动了致糖尿病的病理生理过程。不过，从目前的资料来看，GDM的基因背景尚不清楚，HLA多态性与GDM的关系研究尚少，结论矛盾之处仍较多，因而，需进一步深入探讨。

为确定GDM有无遗传性，有人选择了100例GDM的妇女在产后11年进行了跟踪研究，发现有61例发展为IGT或2型DM，对其父母进行调查发现父母双方的IGT或2型DM的发病率并没有明显增加，提示GDM的病因可能是多基因遗传性或是环境因素起作用而非常染色体显性遗传。另外，大约有不到10%的GDM孕妇可能有常染色体变异，类似于各青春期糖尿病（MODY），在GDM孕妇中，目前检测到MODY的数个亚型存在。但这可能在孕前即已存在无症状的DM，只是在孕期因首次常规筛选而作出DM的诊断而被误认为是GDM而已。

在探讨1型DM与免疫方面有某种相关性时用胰岛细胞抗体（ICA）、胰岛素自身抗体（IAA）及谷氨酸脱羧酶自身抗体（GAD）以预测1型DM的发生。因为这些指标在1型DM患者有较高的检出率，有时甚至在1型DM发病前数年即可检出。同样在GDM患者身上也检测这些免疫学指标试图探讨与GDM有无类似相关性。GDM患者中ICA的检出率较早报道在38%。近年研究表明，用较敏感和更特异的方法检测阳性率较低，有研究发现GDM者ICA的阳性率为2.9%（4/139），然而尽管其滴定度低（＜20 U），ICA阳性预测发展为1型DM可达75%，其敏感性为50%，特异性达99%。美国的一项187例以往GDM的患者中发现ICA阳性率较低，187例只发现3例为ICA阳性，这3例患者，空腹血糖较高，或是IGT或是胰岛素第一时相反应下降。多数研究都表明GDM中ICA阳性的发生较低，这同样支持GDM者多数将来发展为2型DM而非1型DM。但是若ICA阳性，则需引起重视，因为这些人多数在产后不久发展为1型DM。总之，ICA作为GDM将来发展为2型DM或1型DM的一个预测指标还需要更多的临床研究，才能确定其真正价值。

ICA、IAA及GAD自身抗体的低检出率，表明胰岛β细胞的自身免疫损伤作为GDM病因的可能性不大，但是有GDM病史的妇女，发展为1型DM的时间较短，而用胰岛素治疗的妇女在产后很快会出现1型DM的症状和体征。提示GDM与1型DM之间还有某种未知的关联因素存在。