真菌为真核细胞型微生物，细胞核高级分化，有核膜核仁，胞质内有完整的细胞器，能进行有丝分裂。无叶绿素，不能进行光合作用，只能从外界获得碳源，进行寄生或腐生生活。真菌通过产生孢子进行有性或无性繁殖。

临床上常将真菌分为浅部真菌和深部真菌。浅部真菌主要侵犯机体皮肤、毛发和指（趾）甲，寄生和腐生于表皮、毛发和甲板的角质组织中，引起浅部真菌病。浅部真菌一般不侵入皮下组织或内脏，故不引起全身感染。深部真菌是指侵犯表皮以外组织和器官的病原性真菌和条件致病真菌。病原性真菌本身具有致病性，而条件致病菌一般不具有致病性，只有在一定条件下，即机体免疫力下降时才致病。近年来，由于广谱抗生素、免疫抑制剂等的滥用，器官移植、介入性治疗技术的开展，艾滋病、尿毒症、恶性肿瘤等引起机体免疫功能下降等原因，真菌发病率特别是条件致病性真菌感染有明显上升趋势。常见真菌分类见表2-3-1。

真菌检查方法包括直接镜检、培养和组织病理检查。真菌培养是目前鉴定真菌的唯一方法，目的在于从临床标本中分离出病原菌，以确定是否有真菌感染以及致病菌的种类，从而指导临床治疗。培养基一般采用沙氏琼脂培养基。对一些与外界相通的部位如口腔、气管、阴道等处获得的标本中，如果分离出真菌，应结合临床，慎重判断，因为这些部位可能原本就有真菌寄居或污染。自无菌部位采取的标本如脑脊液和血液中分离出任何真菌都应视为有诊断意义。

念珠菌属于酵母菌，又称假丝酵母菌，在机会真菌或条件致病真菌中最常见，其所致疾病在侵袭性真菌病中占首位。念珠菌属广泛存在与人体和环境中，是人体正常菌群之一，定植于人体与外界相通的各个器官，包括口咽部、鼻咽部、胃肠道、泌尿生殖道等。引起人类感染者主要为白色念珠菌、光滑念珠菌、热带念珠菌、克柔念珠菌、近平滑念珠菌等，以白色念珠菌最为常见。内源性感染是其主要感染途径，也存在人与人之间传播，可引起皮肤、黏膜、内脏和各个系统器官的侵袭性念珠菌病。发生侵袭性念珠菌病的主要危险因素包括念珠菌定植、接受广谱抗菌药治疗、全身应用糖皮质激素、导管插管、外科手术、烧伤、糖尿病、HIV感染等。以下为常见念珠菌病：①黏膜念珠菌病：以白念珠菌口炎最为常见，又叫“鹅口疮”，还可引起食管念珠菌病、阴道念珠菌病等；②皮肤念珠菌病：常累及光滑皮肤相互直接摩擦、局部潮湿和通气不良的部位，可引起皮损部位红斑、水疱、瘙痒等；③脏器受累：肺炎、支气管炎、膀胱炎、肾盂肾炎、脑膜炎、心内膜炎、骨髓炎、关节炎等。

隐球菌属中，仅新型隐球菌及其变种具有致病性，荚膜多糖是最主要的致病因子之一。该菌存在于土壤和鸽粪中，鸽子是最重要的传染源，通过呼吸道和皮肤传播，主要引起隐球菌病，隐球菌病是一种亚急性或慢性深部真菌病，主要侵犯中枢神经系统和肺，但亦可侵犯皮肤和黏膜或其他内脏。

曲霉属是一种腐生丝状真菌，广泛存在于自然环境中，易在土壤、水、食物、植物和空气中生存。曲霉能侵犯机体许多部位，统称曲霉病，最常见的侵犯部位为肺和鼻窦，也可侵犯皮肤、黏膜、脑、眼、耳等部位。免疫功能正常者以非侵袭性曲霉病为主，免疫功能低下者以侵袭性曲霉病为主。曲霉感染的病原菌以烟曲霉最常见，鼻窦曲霉感染通常为烟曲霉和黄曲霉所致，播散性曲霉病病原主要为烟曲霉、黄曲霉等。曲霉球常由黑曲霉、烟曲霉等所致。

毛霉广泛存在于自然环境中，常引起食物霉变，毛霉引起的感染称为毛霉病，重症疾病的晚期及机体抵抗力极度衰弱时是致病的诱发因素，感染途径多为吸入空气中的孢子，首先发生在鼻或耳部，经口腔唾液流入上颌窦和眼眶，引起坏死性炎症和肉芽肿，再经血流侵入脑部，引起脑膜炎，亦可扩散至肺、胃肠道等全身各器官，死亡率较高。

最初认为卡氏肺孢子菌是引起人类卡氏肺孢子菌肺炎的病原体，但2002年发现耶氏肺孢子菌才是真正的病原菌，卡氏肺孢子菌仅引起豚鼠致病。肺孢子菌肺炎是由耶氏肺孢子菌引起的呼吸系统真菌感染性疾病。它的病理和临床特点是间质性肺炎，多见于免疫功能低下或免疫缺陷者，是AIDS最常见的机会性感染之一。主要临床表现为发热、干咳、进行性呼吸困难、乏力、盗汗、消瘦。部分患者可有发绀、胸痛等症状。自觉症状较重，而体征较少是本病的重要特征。