异基因造血干细胞移植（allo-HSCT）是血液系统疾病，尤其是恶性血液病有效乃至唯一的根治手段。涵盖免疫耐受和免疫重建等在内的免疫学问题是allo-HSCT的核心科学问题。免疫学在临床上涉及造血干细胞（HSC）植入和（或）移植排斥、病原微生物感染的发生及转归、移植物抗宿主病（GVHD）、移植物抗白血病（GVL）效应以及移植后的固有和适应性免疫重建等诸多问题。明确供者免疫细胞对受者细胞上表达的主要和（或）次要组织相容性抗原发生的免疫识别和免疫反应的本质对于解决移植过程中的免疫问题至关重要。关于免疫学的基础知识已经有多部相关专著详细阐述，本章内容主要涉及HLA、自然杀伤（NK）细胞同种反应性、T细胞对同种抗原的识别和免疫耐受诱导以及供者特异性HLA抗体在移植排斥中的作用等移植免疫学相关内容及其在allo-HSCT治疗恶性血液病中的应用。