根据全球基金批复的工作预算，截至2014年6月30日，耐多药项目总预算23 606万美元，其中全球基金资助21 617万美元，政府配套1989万美元。省级总经费9942万美元，其中全球基金资助8064万美元，省级配套1878万美元；国家级总经费13 663万美元，其中全球基金资助13 552万美元，政府配套111万美元。各轮项目预算情况如下：

第五轮耐多药项目总预算为1678万美元，其中全球基金资助1355万美元，政府配套323万美元。省级项目总经费为783万美元，其中全球基金资助508万美元，省级配套275万美元。国家级总经费896万美元，其中全球基金资助848万美元，政府配套48万美元。

第七轮耐多药项目一期经费总预算为620万美元，全球基金资助531万美元，政府配套89万美元。省级项目总经费273万美元，其中全球基金资助201万美元，省级配套72万美元。国家级总经费347万美元，其中全球基金资助331万美元，政府配套16万美元。

整合耐多药项目总预算为12 335万美元，其中全球基金资助11 766万美元，政府配套569万美元。省级项目总经费6286万美元，其中全球基金5763万美元，省级配套523万。国家级总经费6048万美元，其中全球基金资助6002万美元，政府配套46万美元。

延期耐多药项目总预算为8972万美元，其中全球基金资助7964万美元，政府配套1008万美元。省级项目总经费2601万美元，其中全球基金资助1593万美元，省级配套1008万美元。国家级总经费6372万美元，全部来自全球基金资助。

各轮经费预算见表1-8。