核酸检测和CT检查是新型冠状病毒肺炎的两种诊断手段，不能互相取代。

核酸检测作为病原诊断的重要依据，也是确诊的最重要依据。局限性在于试剂盒的质量、标本采集的质量和采集的时间以及检测技术员的操作等原因，可能会出现假阴性结果；同时，如果患者体内病毒载量较小，核酸检测也可能出现阴性结果。此外，检测也受限于试剂盒的可及性以及耗时。应注意核酸检测出阳性虽为确诊手段，但不能对肺炎病情的严重程度及其发展过程作出评判。

CT作为新型冠状病毒肺炎的诊断标准之一，其检测的优势是迅速，对疾病的严重程度和发展可以有更直观的影像资料；对于有流行病学史且CT证实为肺炎的患者，即使核酸检测阴性，也应作为疑似病例隔离治疗，不会因为核酸检测阴性而放走患者造成疫情播散。CT的局限性在于：相当一部分新型冠状病毒感染患者没有肺炎表现，无法靠CT来发现；此外，新型冠状病毒肺炎的影像学表现与其他肺部感染尤其是其他病毒性肺炎，甚至支原体肺炎等的征象有类似的地方，所以用CT鉴别肺炎的病原体是不可靠的；部分医院也受限于CT的可及性，且CT检查时存在交叉感染的风险。