2012年7月,在分析现阶段欧洲研究区发展的主要阻碍因素后,欧盟委员会制定了欧洲研究区的五大优先发展领域,分别是:更有效的国家研究系统;优化跨国合作和竞争;为研究者提供开放的劳动力市场;在研究领域实现性别平等和性别主流化;优化科学知识的流通、获取和转化。随着社会的发展,欧盟对欧洲研究区的优先发展领域进行了更新,2016年最新发布的《欧洲研究区发展报告》将国际合作列入了欧洲研究区的优先发展领域。