贲门失弛缓症临床并不多见,现有报道提示其发病率在每年0.03/10万~1.63/10万。本病男女发病率相似,所有年龄段均可罹患,但有少数研究认为30岁和60岁左右是本病发病的两个高峰,也有研究认为随着年龄的增长,本病的发病风险增加。在美国,贲门失弛缓症的入院治疗率是随着年龄而增加的,从0.25/10万(18岁以内)增加到37/10万(85岁以上)。