创建于1958年，在著名神经病学家曹天祥、康德瑄等老一辈专家辛勤耕耘努力下，逐渐成长壮大。进入20世纪90年代，在新一代学科带头人樊东升教授带领下，科室发展进入了快车道。现在，作为北京市重点学科、教育部博士点与博士后流动站、国家临床药理基地和神经专科医师培训基地，特别是近年来在国家重点建设专科项目支持下，科室在临床诊疗和医学研究方面均居国内先进，是全国乃至全球具有较大影响力的运动神经元病综合诊治中心之一。拥有神经退行疾病、脑血管病、周围神经与肌肉病等七个亚专业及独立的神经电生理、神经超声、分子生物学和神经肌肉病理室。科室获得包括国家八六三重点项目、国家自然科学基金重点项目、科技部重大专项等省部级以上经费数千万元，曾获教育部科技进步一等奖及中华医学科技奖、北京市科技成果奖等，牵头主持北京大学《神经病学》为国家级“精品课程”。科室连续十余年举办国家继教项目“北京大学肌电图与临床神经生理学习班”，主办“北京大学卒中论坛”及与复旦大学华山医院、中山医院联合主办“中国神经病学论坛”等品牌学术会议。是国家卫生计生委及中国卒中学会“高级卒中中心”，并承办卫生计生委卒中筛查防治工程委员会机关刊物《中国脑卒中防治》。