以阿司匹林、氯吡格雷为代表的抗血小板药的主要不良反应是服用后易诱发胃灼热、胃溃疡和出血。为最大限度地减少药品不良反应，2007年美国心脏病学会／美国心脏学会（ACC/AHA）发表的指南强力推荐，既往有消化道出血病史者，在单独服用氯吡格雷或与阿司匹林联合应用时，应加用质子泵抑制剂以降低再出血的风险。

然而，根据近期多个临床报告，美国食品与药物管理局（FDA）于2009年1月发出警告，提示质子泵抑制剂（PPI）可抵消氯吡格雷的心血管保护作用，显著增加心血管不良事件及其再住院率；并于2009年5月要求企业修改说明书，强调要谨慎并用PPI与氯吡格雷，必要时可改用H ₂受体阻滞剂雷尼替丁、法莫替丁（不可选用西咪替丁，因是CYP2C19抑制剂），或胃黏膜保护剂米索前列醇、硫糖铝，或影响较小的雷贝拉唑和泮托拉唑。

奥美拉唑是常用的PPI之一。奥美拉唑会减弱氯吡格雷的疗效的原因是：氯吡格雷是前体药物，它在体内需要经过细胞色素P450酶的代谢，生成能抑制血小板聚集的活性代谢产物发挥作用。已知85%氯吡格雷是经酯酶水解代谢为无活性产物排出体外，仅15%氯吡格雷经肝酶CYP2C19代谢为有活性的产物，发挥抗血小板作用。如果氯吡格雷在较低浓度就可发挥抗血小板作用，意味着血药浓度的微小变化（增高或降低）就能影响其疗效的强弱。

奥美拉唑既是CYP2C19的底物，又是CYP2C19的强抑制剂，与氯吡格雷同服，可抑制其转换为有活性的代谢物，也就不能拮抗血小板聚集而阻止血栓。

奥美拉唑与氯吡格雷同服，奥美拉唑可与氯吡格雷竞争性抑制CYP2C19活性，从而大大减少了氯吡格雷代谢为有活性的产物，即氯吡格雷的血浆药物浓度大幅度降低，其抗血小板作用也必然减弱。所以奥美拉唑不宜与氯吡格雷同服。