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下丘脑-垂体-卵巢-子宫轴
雌、孕激素是由卵巢分泌，但是女性生殖内分泌的最高司令部在下丘脑。
下丘脑脉冲式分泌促性腺激素刺激激素（GnRH），来促进垂体分泌两种激素，而且还通过脉冲的频率来调节两种垂体促性腺素之间的比值。现在，人们已经研究出GnRH的促进剂和抑制剂，并且应用于临床，治疗子宫肌瘤、子宫内膜异位症，效果显著。不过，由于研发成本高，上市不久，这类药物目前价格很贵。
垂体最初被称为“生物钟”，这个名称非常形象，垂体参与调控人类生理周期。在妇科内分泌系统，垂体接收GnRH的指令后，分泌出卵泡刺激素（FSH）和黄体生成素（LH），这两种激素作用到卵巢，刺激卵泡发育和排卵，决定雌、孕激素的血液激素水平、持续时间、高峰和撤退。
这三种激素比较难于记忆。
GnRH，现在人们把它的类似物制成一种药，治疗雌激素依赖肿瘤，价格很贵，但是非常有效，又称为“药物性卵巢切割”，后面几种疾病的治疗都要提到。
FSH，人们通过检测这种激素，来判断40岁以前就绝经的妇女，究竟是一过性卵巢功能障碍，还是真正的卵巢早衰。它还可以制成促排卵药。
LH，药用价值不突出，但是，大家熟悉的“排卵试纸”就是利用测定尿中LH来预测排卵，指导受孕。
这样就好记多了。
雌、孕激素对下丘脑的促性腺激素释放又有反馈作用。下丘脑和垂体上都有雌、孕激素的感受器。
下丘脑是妇女内分泌系统的中枢，临床上可见脑瘫或脑炎后遗症的少女，会发生难以控制的功能失调性子宫出血，原因就是大脑缺血缺氧，发生不可逆的损伤，累及了下丘脑。在中枢神经水平破坏了女性内分泌系统，即使有发育正常的子宫和卵巢，也不可能有正常的月经。
垂体是妇女内分泌系统重要的中继站和调控中心。垂体缺血性梗死被称作“席汉综合征”，是失血性休克的后遗症，患者表现为闭经，第二性征退化——生殖器官和乳房萎缩，性欲减退，淡漠，畏寒，疲乏无力。
卵巢发育不良者，体内检测不到雌激素或雌激素过低的患者，身材矮小，没有女性特征和月经，往往合并智力低下，可见雌激素对女性发育有至关重要的作用。