当希腊联军向特洛伊杀奔而去时，或许谁也没有想到这场战争将会陷入僵局。因为阿伽门农几乎是倾全希腊之力攻打特洛伊一个城邦，军队数量上更是远胜于特洛伊。所以当预言家卡尔卡斯指出献祭时的玄机，认为战争将会旷日持久时，并没有多少人相信。但是一语成谶的是，希腊联军真的围城九年后方才依靠一个妙计，叩开特洛伊的城门。起初特洛伊城的百姓几乎都被希腊联军的阵势吓破了胆，不战而降的声音不绝于耳。但是不同于闯祸的小王子帕里斯，特洛伊王普里阿摩斯的大儿子赫克托耳则是个有担当的大英雄，他的名望更是在敌军阵中传颂。在赫克托耳的指挥下，特洛伊据守不出，任凭希腊联军占领了周围和特洛伊结盟的城邦、血洗忒拜，也毫无应战的欲望。九年便在不知不觉中流逝，其间希腊联军发动过三次强攻，但都收效甚微。相反，众多英雄在此期间战死，其中包括第一个用鲜血染红特洛伊土地的普罗忒西拉厄斯、遭受奥德赛陷害的帕拉墨得斯，甚至是无坚不摧的阿喀琉斯，等等。特洛伊方面最终也失去了城邦的保卫者赫克托耳。九年间，双方互相展开过偷袭，在希腊联军大寨中、海边、特洛伊城下，进行了不计其数的战斗，但是都无法彻底击垮对方。

最终奥德赛在战争的第十个年头想出了一条妙计。他命令希腊人建造一匹巨大的木马，并在其中安排藏匿了许多强壮的希腊英雄。之后命令联军撤离特洛伊海岸，等到特洛伊人将木马当作战利品拖进城里，再里应外合，一举击溃对手。这一智取的计谋果然奏效，在躲过了特洛伊人的审查之后，木马中的希腊勇士打开城门，特洛伊城在神的旨意中被攻克了，并最终被付之一炬，伟大的特洛伊战争也就此结束。