佛部、莲花部、金刚部、宝部和羯磨部 金胎两界本尊
密教认为大日如来是宇宙的象征，其智德与慈悲，构成了整个宇宙。前者为金刚界，后者为胎藏界。
金刚界和胎藏界
藏传佛教视大日如来为宇宙的象征，其智德与慈悲，构成了整个宇宙，宇宙的一切皆为大日如来所显现。表现其智德的是金刚界，梵文为Vajradh
tu，比喻大日如来之智德如金刚般坚强不摧，并能摧破一切烦恼魔障；表现其慈悲的为胎藏界，梵文为Garbhadh
tu，比喻大日如来的慈悲好像母亲怀育胎儿，又好像莲花的种子蕴含在花中，佛性隐藏于众生身中，或理性摄一切诸法，具一切佛功德。
据《金刚顶经》将金刚界绘制出来，便是金刚界曼荼罗，据《大日经》将胎藏界绘制出来，便是胎藏界曼荼罗。两部曼荼罗中佛、菩萨、金刚众多，但均摄于独一法身大日如来。
三轮、三部、五部本尊
金刚界、胎藏界诸尊有三轮、三部、五部的分法。三轮指的是自性轮、正法轮、教令轮。自性轮指的是表现佛陀本来自性的本尊，如大日如来、宝生佛、无量寿佛等，多为寂静相；正法轮身指的是为弘扬正法而示现的悲智之佛、菩萨，如释迦牟尼佛，观世音、文殊、普贤、地藏等菩萨；教令轮身指的是为度刚强难化的众生而示现的身相，如五大明王，均为忿怒相。
胎藏界配以大定、大悲、大智三德，则分为佛部、莲花部和金刚部三部。佛部为大定门，以大日如来为代表；莲花部为慈悲门，以观世音菩萨为代表；金刚部为智慧门，以金刚萨埵为代表。金刚界与胎藏界中诸尊，都可摄于这三部之中。
金刚界配以五智（法界体性智、大圆镜智、平等性智、妙观察智、成所作智），又可分为五部，除了莲花部、佛部、金刚部，还有宝部和羯磨部。宝部为佛成就福德无边，以宝生如来为代表；羯磨部又称为事业部，指佛为众生而垂悲悯，成办一切事业，以不空成就如来为代表。
金刚界曼荼罗
金刚界曼荼罗表现的是大日如来的智德，金刚即坚固不摧的意思，比喻如来能打破众生无明，唤醒众生的佛性。金刚界曼荼罗中共有1461尊，又分为九会曼荼罗，也就是金刚界的九个曼荼罗。
金刚界九会
成身会：又叫羯磨会，是金刚界九会曼荼罗的根本，中央为五方佛。大日如来之外的四方佛周围又有贤劫十六尊的男女尊形，共37尊。
三昧耶会：位于东方，是塔、杵、珠、刀、剑等本尊标帜，是本尊自证化他的本誓相状，即“三昧耶形”。
微细会：位于东南方，本尊画在三股杵中，表示其住于微细智中。
供养会：位于南方，表现诸本尊的供养仪式。
四印会：位于西南方，综合以上四会，摄四会于一会，所以叫四印会。
一印会：位于西方，表示大日如来独一法身，四会归一的意思。
理趣会：位于西北方，表示大日如来现金刚萨埵之身以正法度化众生。
降三世会：位于北方，诸尊皆现忿怒的“降三世明王”之身，表示降伏四魔及三毒。
降三世三昧耶会：位于东北方，与降三世会同，但此会是降三世的三昧耶形。
胎藏界曼荼罗
胎藏界曼荼罗表现的是大日如来的慈悲，比喻大日如来的慈悲好像母亲怀育胎儿，又好像莲花的种子蕴含在花中，佛性隐藏于众生身中，或理性摄一切诸法，具一切佛功德。胎藏界包含中央九尊及十二院，共计414尊。
三轮、三部和五部
金刚界和胎藏界曼荼罗中各有数百位本尊，这些本尊除了按其在曼荼罗中的位置及象征意义有九会、十二院的分法外，还有三轮、三部、五部的分法。
三轮
各位本尊按其分身可分为自性轮、正法轮和教令轮三轮。
胎藏界三部
胎藏界曼荼罗配以大定、大悲、大智三德，则分为佛部、莲花部和金刚部三部。
金刚界五部
金刚界配以五智分为五部
