吉林省有大小河流2000余条，河长在100千米以上的有38条，30千米以上的有221条。分属于松花江、辽河、鸭绿江、图们江和绥芬河5大水系。其中松花江水系以涵盖河流多、流域面积大、河流长而在众多水系中占有重要位置。吉林省境内的湖泊主要分布于东部地区，其中最著名的湖泊是长白山天池和三角龙湾。吉林省境内温泉资源比较丰富，其中长白山温泉群、仙人桥温泉群等规模较大。抚松矿泉群和靖宇矿泉群是我国矿泉密集的重要矿泉疗养区，也是众多品牌矿泉水的水源地。
